研究院以陆海相互作用为核心研究主线，以生态保护修复技术研发和生态产业构建优化为双重目标，重点布局海岸带保护与生态修复、近海资源保育、滨海盐碱地生态建养三大方向。围绕这三大方向，系统开展滨海湿地生物地球化学过程与生态效应、滨海湿地退化过程与退化湿地生态修复、近海生态系统健康评估与生物资源保育、滨海盐碱地生态建养与可持续利用、砂质海岸侵蚀机理与海滩养护修复等研究，持续推动多学科交叉融合，不断拓展研究的深度与广度。
研究院拥有一支结构合理、富有创新活力的高水平科研教学队伍。现有职工19人，其中教授6人、副教授8人，专任教师中高级职称占比87.5%。队伍中汇聚了山东省有突出贡献中青年专家、山东省泰山学者青年专家、黄河三角洲学者等一批高层次人才，在引领学科前沿、承担重大课题、培育后备力量等方面发挥着核心骨干作用。
研究院具备突出的科研创新能力。“十四五”期间，科研成果丰硕，累计获批纵向项目24项，其中国家自然科学基金9项，纵向科研经费达634万元；同时积极服务地方经济社会发展，横向课题到账经费突破3500万元，产学研用协同成效显著。研究院建有“山东省滨海生态环境保护与修复协同创新中心”、“山东省滨海湿地生态修复与保育重点实验室”、“山东省海洋牧场监测工作站”3个省级科研平台，并深度参与“山东省河口海岸与核环境重点实验室”建设，为开展原创性研究、突破关键技术、提供社会服务提供了坚实支撑。
研究院独立招收地理学、水产养殖学硕士研究生，构建“科研驱动、实践赋能、升学就业并重”的培养体系，研究生100%参与科研项目。已累计培养硕士研究生55人，其中15人考取博士研究生，占毕业生总数的27%，现有在读硕士研究生36人，人才培养质量优异。
研究院秉持开放合作理念，积极融入全球滨海生态研究网络。国内与中科院相关院所、北京师范大学、山东大学等建立协同创新关系，与黄河三角洲自然保护区管理局及东营、烟台市政府等开展联合攻关与成果转化；国际与湿地国际、美国路易斯安那州立大学、德国马普研究所等知名机构建立稳定合作关系，通过联合研究、学者互访、学术交流等形式，持续提升学科知名度与国际影响力。
立足现有基础，面向“十五五”，研究院将全面实施“一二三四”发展战略：即紧紧围绕“提升科技创新能力和核心竞争力”这一核心目标，坚持基础研究与应用研究双轮驱动，突出抓好重点方向、重点人才、重点平台三大建设，统筹推进科学研究、团队建设、人才培养、社会服务四大任务。力争到2030年，在滨海湿地生态修复、盐碱地生态改良等领域形成国内特色优势，全面建成在国内滨海生态领域具有较强影响力和竞争力的高水平科研机构，成为学校学科建设的闪亮名片、科研创新的核心平台、服务地方的重要窗口，为滨海区域生态环境与经济社会协调发展持续贡献创新力量。
